La CENU collabora con diverse Commissioni in vari settori:

• Commissione nazionale d'etica per la medicina umana CNE
• Commissione federale di esperti per la sicurezza biologica CFSB
• Commissione federale per la sperimentazione sugli animali CFSA

Le competenze legislative ed esecutive nel settore della biotecnologia e dell'ingegneria genetica sono ripartite fra diversi Uffici federali, ognuno dei quali persegue obiettivi di protezione specifici (ambiente, salute umana, agricoltura svizzera, animali). La CENU svolge il ruolo di Commissione consultiva nell'ambito della procedura legislativa e delle procedure di autorizzazione.

• <link https: www.bafu.admin.ch bafu it home.html _blank link esterno in nuova> Ufficio federale dell'ambiente (UFAM)
• <link https: www.bag.admin.ch bag it home.html _blank link esterno in nuova>Ufficio federale della sanità pubblica (UFSP)
• <link https: www.blw.admin.ch blw it home.html _blank link esterno in nuova>Ufficio federale dell'agricoltura (UFAG)
• <link https: www.blv.admin.ch blv it home.html _blank link esterno in nuova>Ufficio federale della sicurezza alimentare e di veterinaria (USAV)